28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0364 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  100 
 
 		 90 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  74.71 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  73.56 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  64.1 
 
 		 80 aa  98.2  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  64.29 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  55.29 
 
 		 93 aa  87  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  48.81 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  48.15 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  44.3 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  43.33 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  43.33 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  43.42 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  48.24 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  36.26 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  40 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  33.73 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  32.97 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  43.37 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  33.73 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  33.73 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  34.44 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  34.44 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  35.56 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  33.72 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  38.37 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  36.05 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  43.59 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  36.26 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>