23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0894 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  100 
 
 
86 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  89.53 
 
 
86 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  89.53 
 
 
86 aa  159  9e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  77.91 
 
 
86 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  77.91 
 
 
86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  77.91 
 
 
86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  72.41 
 
 
87 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  66.28 
 
 
86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  56.98 
 
 
89 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  56.98 
 
 
88 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  46.51 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  45.24 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  45.88 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  45.88 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  45.35 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  35.71 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  36.9 
 
 
86 aa  60.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  39.33 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  47.5 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  36.05 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  32.91 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  33.75 
 
 
84 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  36.36 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>