46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4943 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4943  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00429148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1547  hypothetical protein  71.6 
 
 		 254 aa  354  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  32.42 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  32.02 
 
 		 191 aa  89  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  34.81 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  30.22 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  34.83 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  30.43 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  29 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  29.79 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  0.000000000926044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  29.35 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  32.09 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  32.6 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  27.81 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  27.54 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  25.47 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  28.34 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  33.15 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  33.15 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  33.15 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  29.21 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  32.78 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0023  hypothetical protein  30.34 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  28.28 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  30.73 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00685  hypothetical protein  31.15 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0834282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2900  hypothetical protein  26.88 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0746  hypothetical protein  29.68 
 
 		 172 aa  62  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  28.71 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  28.4 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3640  hypothetical protein  27.32 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000000227371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  35.79 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  27.57 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  28.26 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  28.71 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2641  hypothetical protein  25.26 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4158  signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 98 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2437  hypothetical protein  29.05 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  29.27 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  25.84 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  28.21 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4483  hypothetical protein  26.97 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0500  hypothetical protein  27.81 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2460  hypothetical protein  27.13 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0108  hypothetical protein  22.46 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  1.3521599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>