60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2231 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  75 
 
 		 224 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  39.32 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  60 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  41.36 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  35.02 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  42.94 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  33.49 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  42.21 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  39.24 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  32.08 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  0.000000000926044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  34.85 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  36.95 
 
 		 248 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  37.2 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  36.48 
 
 		 196 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0500  hypothetical protein  37.89 
 
 		 197 aa  92.4  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  37.74 
 
 		 197 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  34.78 
 
 		 187 aa  92.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  35.9 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  34.46 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  34.46 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  34.46 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  35.65 
 
 		 208 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  36.09 
 
 		 190 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  33.33 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3640  hypothetical protein  33.76 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000000227371  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0108  hypothetical protein  30.92 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  1.3521599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  34.81 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2460  hypothetical protein  31.74 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4943  hypothetical protein  30.43 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00429148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  31.68 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2437  hypothetical protein  34.09 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0023  hypothetical protein  30.86 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  33.08 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00685  hypothetical protein  31.22 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0834282  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  30.06 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2641  hypothetical protein  29.75 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1547  hypothetical protein  30.27 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2900  hypothetical protein  31.71 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  28.48 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0746  hypothetical protein  31.3 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  34.35 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4483  hypothetical protein  32.91 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  29.82 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4158  signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 98 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2180  hypothetical protein  32.32 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2841  zeta toxin  28.18 
 
 		 450 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21799 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 472 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  28.46 
 
 		 492 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  27.16 
 
 		 477 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2345  hypothetical protein  36.07 
 
 		 98 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.938426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  27.69 
 
 		 488 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  25 
 
 		 498 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  25.68 
 
 		 521 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  26.87 
 
 		 500 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  26.92 
 
 		 452 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  26 
 
 		 483 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  27.48 
 
 		 482 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  24.34 
 
 		 452 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>