36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4158 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4158  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 98 aa  197  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  67.35 
 
 		 196 aa  140  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  64.29 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  38.46 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  44.32 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  36.56 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  0.000000000926044 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4943  hypothetical protein  45 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00429148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  42.05 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  42.05 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  42.05 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  39.34 
 
 		 233 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  39.66 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  40.51 
 
 		 298 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  35.71 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  36.76 
 
 		 303 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  36.49 
 
 		 212 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1547  hypothetical protein  41.67 
 
 		 254 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  35.79 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  29.67 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  34.83 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  40.35 
 
 		 266 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  36.84 
 
 		 248 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  28.74 
 
 		 247 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  35.63 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  34.52 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  35 
 
 		 211 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2460  hypothetical protein  36.76 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2345  hypothetical protein  33.85 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.938426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  32.93 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  33.68 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  37.1 
 
 		 180 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  41.67 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>