49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7291 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0500  hypothetical protein  39.76 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  37.2 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  31.43 
 
 
303 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  34.03 
 
 
223 aa  105  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  39.18 
 
 
180 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  32.16 
 
 
204 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2641  hypothetical protein  37.11 
 
 
177 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2900  hypothetical protein  33.65 
 
 
204 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  34.72 
 
 
191 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  34.87 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0023  hypothetical protein  38.27 
 
 
173 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  39.22 
 
 
172 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3640  hypothetical protein  38.01 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000000227371  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  37.2 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  34.07 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  39.51 
 
 
175 aa  95.9  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2437  hypothetical protein  36.53 
 
 
174 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  34.5 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4483  hypothetical protein  36.97 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  36.14 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  34.39 
 
 
298 aa  88.2  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0746  hypothetical protein  35.93 
 
 
172 aa  86.3  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  26.92 
 
 
248 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  31.07 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0108  hypothetical protein  31.79 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  1.3521599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  32.07 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  28.75 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  32.07 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  32.07 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  30.63 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  32.39 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  26.4 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00685  hypothetical protein  30.85 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0834282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  29.9 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2460  hypothetical protein  31.87 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  32.12 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  0.000000000926044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1547  hypothetical protein  34.05 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  32.2 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4943  hypothetical protein  32.09 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00429148  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  35 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  30.7 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  32.12 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2180  hypothetical protein  31.86 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  31.82 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4158  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
98 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4157  hypothetical protein  40.51 
 
 
104 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2345  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  41.6  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.938426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>