20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4157 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4157  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  72.73 
 
 		 196 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  68.49 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  47.3 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  47.3 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  47.3 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  47.37 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  45.45 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  41.89 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  42.11 
 
 		 298 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  38.75 
 
 		 204 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  37.97 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  41.89 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  53.85 
 
 		 266 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  41.03 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  48.65 
 
 		 247 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  40.51 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  37.33 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  46.34 
 
 		 208 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  38.16 
 
 		 233 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>