47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5582 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  75 
 
 		 209 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00685  hypothetical protein  58.05 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0834282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2180  hypothetical protein  51.71 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  45.79 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  35.45 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  34.55 
 
 		 190 aa  89  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  32.16 
 
 		 180 aa  84.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  35.85 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  29.95 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0023  hypothetical protein  33.12 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  34.1 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2900  hypothetical protein  33.73 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3640  hypothetical protein  30.86 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000000227371  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  35.37 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  30.06 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  33.53 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  33.77 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0500  hypothetical protein  31.9 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0108  hypothetical protein  28.83 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  1.3521599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  30.82 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2437  hypothetical protein  32.53 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  30.52 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  32.12 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4483  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  30.65 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2641  hypothetical protein  34.69 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  33.53 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  27.92 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  28.95 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  0.000000000926044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2460  hypothetical protein  28.8 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  30.72 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  29.09 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4943  hypothetical protein  29.27 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00429148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  26.17 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4158  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 98 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  27.07 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  27.07 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  27.07 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2345  hypothetical protein  38.46 
 
 		 98 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.938426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  22.37 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1547  hypothetical protein  24.46 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  29.26 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  27.59 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>