41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4012 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4012  methyltransferase type 12  100 
 
 		 345 aa  708    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2368  methyltransferase type 12  35.32 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0441  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 209 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 279 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  30.43 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  24.75 
 
 		 233 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  25.33 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5826  methyltransferase type 11  23.74 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.790939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6585  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.9 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  24.59 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.03 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4538  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.46 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.17 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6084  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.64 
 
 		 229 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  17.52 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  51.06 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  17.52 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.21 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  17.52 
 
 		 387 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.53 
 
 		 245 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.43 
 
 		 244 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 253 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.29 
 
 		 307 aa  42.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  23.28 
 
 		 239 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 260 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 		 253 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>