32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  100 
 
 		 144 aa  283  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  58.99 
 
 		 144 aa  154  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  39.13 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  40 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  38.62 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  37.07 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  40.87 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  38.02 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  34.27 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  44.57 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  33.83 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  40.98 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3874  hypothetical protein  44.7 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3860  hypothetical protein  44.7 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00794902  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3948  hypothetical protein  44.7 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000500606  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  32.33 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1923  Protein of unknown function DUF2550  40.18 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.701669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  38.39 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  35.2 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.691478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  42.22 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11339  hypothetical protein  42.45 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4326  hypothetical protein  42.59 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  38.02 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2320  hypothetical protein  39.81 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  33.58 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1772  hypothetical protein  31.69 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2446  hypothetical protein  38 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148013  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  31.43 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1074  Protein of unknown function DUF2550  33.72 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10050  Protein of unknown function (DUF2550)  30.84 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19110  Protein of unknown function (DUF2550)  33.62 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>