24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0655 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  353  6.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.691478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  38.89 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  37.59 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  35.83 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  34.29 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  39.05 
 
 
146 aa  61.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  36.57 
 
 
144 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  32.14 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  31.93 
 
 
152 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1923  Protein of unknown function DUF2550  32.2 
 
 
154 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.701669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  35.34 
 
 
143 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1074  Protein of unknown function DUF2550  37.62 
 
 
148 aa  51.6  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  34.15 
 
 
160 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  44.66 
 
 
134 aa  50.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  29.35 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  30.28 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  35.29 
 
 
154 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  31.78 
 
 
132 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  29.58 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  30.48 
 
 
141 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1772  hypothetical protein  30.07 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2446  hypothetical protein  30.97 
 
 
139 aa  41.2  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>