23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2446 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2446  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  277  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10050  Protein of unknown function (DUF2550)  51.69 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1772  hypothetical protein  43.15 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  43.57 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  36.88 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  37.23 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1074  Protein of unknown function DUF2550  39.06 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  34.33 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  38 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  32.35 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  34.82 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  36.96 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  35.65 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  36.19 
 
 
134 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  31.47 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19110  Protein of unknown function (DUF2550)  31.3 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  36.47 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  30.99 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  29.91 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  30.97 
 
 
181 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.691478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>