31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4009 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  92.72 
 
 		 151 aa  282  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  57.14 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  40.44 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  41.48 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  46.09 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  38.52 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  35.82 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  39.37 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  44.83 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  41.46 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  40.98 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  42.22 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  39.13 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  32 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  35.82 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  34.78 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  29.46 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11339  hypothetical protein  41.76 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  36.36 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4326  hypothetical protein  40.66 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3948  hypothetical protein  42.22 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000500606  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  38.04 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.691478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3874  hypothetical protein  42.22 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3860  hypothetical protein  42.22 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00794902  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2320  hypothetical protein  37.37 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19110  Protein of unknown function (DUF2550)  37.61 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2446  hypothetical protein  36.47 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1772  hypothetical protein  26.52 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10050  Protein of unknown function (DUF2550)  30.69 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1923  Protein of unknown function DUF2550  31.25 
 
 		 154 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.701669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>