29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11339 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11339  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  288  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3874  hypothetical protein  80.15 
 
 
148 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3948  hypothetical protein  80.15 
 
 
148 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000500606  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3860  hypothetical protein  80.15 
 
 
148 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00794902  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4326  hypothetical protein  80.7 
 
 
141 aa  185  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0306125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2320  hypothetical protein  81.42 
 
 
141 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145591  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  43.75 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1923  Protein of unknown function DUF2550  43.7 
 
 
154 aa  94  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.701669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  41.96 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  40.35 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  41.88 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  31.21 
 
 
143 aa  67  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  41.49 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  38.52 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  39.32 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  34.21 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  30.5 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  34.62 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  37.76 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  31.62 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  35.05 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  34.78 
 
 
132 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  35.79 
 
 
154 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  32.43 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  31.15 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.691478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2616  hypothetical protein  28.21 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.381401  hitchhiker  0.0010663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  32.22 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1772  hypothetical protein  34.38 
 
 
146 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2984  hypothetical protein  26.92 
 
 
186 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>