27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2129 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  38.81 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  39.13 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  35.56 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  38.66 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  35.9 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  34.31 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  32.37 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  39.25 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  31.65 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  35.38 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  38.02 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  39.82 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  36.52 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1772  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  35.64 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.691478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3874  hypothetical protein  32.12 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3860  hypothetical protein  32.12 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00794902  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3948  hypothetical protein  32.12 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000500606  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10050  Protein of unknown function (DUF2550)  32.35 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  33.06 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11339  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  31.2 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2320  hypothetical protein  33.7 
 
 		 141 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4326  hypothetical protein  35.87 
 
 		 141 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>