26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1272 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  41.1 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  42.75 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  41.61 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  41.22 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  44.63 
 
 		 164 aa  84.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2446  hypothetical protein  42.98 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  40.31 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  38.24 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  39.39 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1772  hypothetical protein  34.51 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  39.47 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  44.57 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  38.94 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  39.67 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  30.99 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  38.98 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  41.96 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10050  Protein of unknown function (DUF2550)  37.61 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  36.3 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.691478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1074  Protein of unknown function DUF2550  34.85 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  32.59 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19110  Protein of unknown function (DUF2550)  31.53 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1923  Protein of unknown function DUF2550  32.32 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.701669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>