32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2603 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  84.62 
 
 
143 aa  253  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  45.1 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  32.59 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  39.02 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  37.17 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  34.38 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  38.64 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  36.67 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  34.45 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2446  hypothetical protein  40.48 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  34.09 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1772  hypothetical protein  32.35 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19110  Protein of unknown function (DUF2550)  35.11 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3874  hypothetical protein  31.91 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3860  hypothetical protein  31.91 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00794902  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3948  hypothetical protein  31.91 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000500606  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  34.41 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  35.54 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4326  hypothetical protein  34.41 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0306125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  27.69 
 
 
141 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1923  Protein of unknown function DUF2550  36.27 
 
 
154 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.701669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10050  Protein of unknown function (DUF2550)  33.33 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11339  hypothetical protein  32.26 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2320  hypothetical protein  31.18 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145591  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1074  Protein of unknown function DUF2550  33.71 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  35.34 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.691478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  31.4 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>