25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3874 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3874  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3948  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000500606  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3860  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00794902  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4326  hypothetical protein  89.47 
 
 		 141 aa  206  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2320  hypothetical protein  87.61 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11339  hypothetical protein  80.15 
 
 		 147 aa  199  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  44.83 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1923  Protein of unknown function DUF2550  46.67 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.701669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  41.26 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  43.7 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  43.97 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  35.9 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  35.14 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  41.49 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  41.94 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  35.45 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  31.54 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  33.59 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0902  hypothetical protein  30.37 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  34.23 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  37.89 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  31.45 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.691478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>