18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11130  xylose isomerase-like enzyme  100 
 
 		 365 aa  724    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.136803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2329  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.72 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305685  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4472  hypothetical protein  50.41 
 
 		 383 aa  315  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3643  hypothetical protein  40.77 
 
 		 392 aa  252  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2288  hypothetical protein  32.23 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.160361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2885  hypothetical protein  33.93 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0191743 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2471  hypothetical protein  36.41 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.056423  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7261  hypothetical protein  34.75 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000187701  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.77 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.728373  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1556  hypothetical protein  34.83 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0427  hypothetical protein  34.02 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2428  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.5 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0018  hypothetical protein  35.7 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0083  hypothetical protein  34.17 
 
 		 407 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0985  hypothetical protein  34.62 
 
 		 400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9147  hypothetical protein  41.78 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3415  xylose isomerase domain-containing protein  39.57 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  26.49 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>