17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0018 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  786    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0985  hypothetical protein  35.52 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2885  hypothetical protein  35.22 
 
 		 400 aa  219  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0191743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0427  hypothetical protein  37.81 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2288  hypothetical protein  36.32 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.160361 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2471  hypothetical protein  37.87 
 
 		 400 aa  212  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.056423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0083  hypothetical protein  36.17 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7261  hypothetical protein  34 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000187701  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1556  hypothetical protein  33.9 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11130  xylose isomerase-like enzyme  34.56 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.136803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.27 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.728373  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3643  hypothetical protein  34.37 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2428  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.75 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2329  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.54 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305685  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4472  hypothetical protein  32.9 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9147  hypothetical protein  30.74 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3415  xylose isomerase domain-containing protein  28.39 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>