17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3415 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3415  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  624  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9147  hypothetical protein  74.13 
 
 		 316 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4472  hypothetical protein  50.21 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2329  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.15 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305685  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11130  xylose isomerase-like enzyme  39.57 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.136803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3643  hypothetical protein  35.79 
 
 		 392 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2288  hypothetical protein  27.17 
 
 		 411 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.160361 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2471  hypothetical protein  32.4 
 
 		 400 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.056423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1556  hypothetical protein  29.23 
 
 		 407 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2428  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.5 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.71 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.728373  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0018  hypothetical protein  28.39 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0427  hypothetical protein  24.24 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2885  hypothetical protein  25.48 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0191743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7261  hypothetical protein  23.9 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000187701  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0083  hypothetical protein  24.36 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0985  hypothetical protein  26.46 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>