17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1822 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 369 aa  755    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.728373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2428  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  94.85 
 
 		 369 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2288  hypothetical protein  40.66 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.160361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1556  hypothetical protein  41.58 
 
 		 407 aa  272  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2885  hypothetical protein  39.44 
 
 		 400 aa  269  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0191743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7261  hypothetical protein  39.03 
 
 		 407 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000187701  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0083  hypothetical protein  39.04 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2471  hypothetical protein  40.26 
 
 		 400 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.056423  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0427  hypothetical protein  36.29 
 
 		 399 aa  248  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0985  hypothetical protein  41.13 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3643  hypothetical protein  35.48 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0018  hypothetical protein  36.27 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11130  xylose isomerase-like enzyme  37.77 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.136803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2329  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.3 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305685  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4472  hypothetical protein  37.1 
 
 		 383 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9147  hypothetical protein  34.09 
 
 		 316 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3415  xylose isomerase domain-containing protein  30.71 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>