17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2428 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  94.85 
 
 		 369 aa  696    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.728373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2428  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 369 aa  753    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2288  hypothetical protein  39.9 
 
 		 411 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.160361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2885  hypothetical protein  40.36 
 
 		 400 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0191743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1556  hypothetical protein  41.33 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7261  hypothetical protein  39.09 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000187701  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0083  hypothetical protein  39.29 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2471  hypothetical protein  40.26 
 
 		 400 aa  252  6e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.056423  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0427  hypothetical protein  36.55 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0985  hypothetical protein  41.09 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3643  hypothetical protein  35.73 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0018  hypothetical protein  35.75 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2329  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.23 
 
 		 388 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305685  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11130  xylose isomerase-like enzyme  37.5 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.136803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4472  hypothetical protein  37.37 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9147  hypothetical protein  33.64 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3415  xylose isomerase domain-containing protein  32.5 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>