13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4398 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4398  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.344761  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4396  hypothetical protein  59.84 
 
 		 163 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17450  hypothetical protein  40.12 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.135372  normal  0.309344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2294  hypothetical protein  52.78 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00049144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3432  hypothetical protein  36.23 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3109  hypothetical protein  31.58 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17440  hypothetical protein  43.38 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.85248  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15940  hypothetical protein  32.05 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329369  normal  0.311733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0724524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3623  hypothetical protein  28.91 
 
 		 185 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17420  hypothetical protein  32.31 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3810  hypothetical protein  29.63 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0328506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3342  hypothetical protein  28.12 
 
 		 187 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>