13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4396 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4396  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  323  6e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4398  hypothetical protein  56.16 
 
 		 297 aa  157  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.344761  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2294  hypothetical protein  54.17 
 
 		 289 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00049144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3109  hypothetical protein  41.51 
 
 		 288 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15940  hypothetical protein  34.86 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329369  normal  0.311733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3432  hypothetical protein  40.46 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17450  hypothetical protein  34.25 
 
 		 460 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.135372  normal  0.309344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1422  hypothetical protein  31.95 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0724524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17440  hypothetical protein  36.59 
 
 		 399 aa  65.1  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.85248  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3623  hypothetical protein  31.3 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3342  hypothetical protein  27.69 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3810  hypothetical protein  35.77 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0328506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17420  hypothetical protein  33.9 
 
 		 233 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.113518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>