15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2294 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2294  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  531  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00049144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3109  hypothetical protein  60.18 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4396  hypothetical protein  52.76 
 
 		 163 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4398  hypothetical protein  46.5 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.344761  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3432  hypothetical protein  37.66 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17450  hypothetical protein  35.02 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.135372  normal  0.309344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3810  hypothetical protein  30.57 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0328506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17420  hypothetical protein  40.32 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33.33 
 
 		 2179 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17440  hypothetical protein  36.44 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.85248  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.77 
 
 		 1888 aa  53.5  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3623  hypothetical protein  28.91 
 
 		 185 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15940  hypothetical protein  29.86 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329369  normal  0.311733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2178  hypothetical protein  27.74 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.96347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3342  hypothetical protein  27.83 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>