27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4169 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4169  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  423  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0623912  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4595  hypothetical protein  88.84 
 
 		 215 aa  347  9e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2318  hypothetical protein  35.58 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.889598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4774  hypothetical protein  40.62 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2307  hypothetical protein  35.24 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2624  hypothetical protein  38.02 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0322  hypothetical protein  32.37 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  36.27 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0421  hypothetical protein  30.33 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0259078  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0677  hypothetical protein  31.02 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0329  hypothetical protein  32.28 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23140  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  33.5 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.541294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0284  hypothetical protein  24.75 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0257  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1435  hypothetical protein  26.67 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185215  normal  0.679893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3089  hypothetical protein  29.49 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1596  hypothetical protein  27.32 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1485  hypothetical protein  24.61 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0313  hypothetical protein  30.48 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0241  hypothetical protein  25.64 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1769  hypothetical protein  25.26 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4170  hypothetical protein  47.14 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0779473  normal  0.935877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00740  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  24.64 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.603366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2159  hypothetical protein  22.89 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0309  hypothetical protein  26.61 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0430221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4596  hypothetical protein  45 
 
 		 114 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0336  hypothetical protein  23.87 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>