21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23140  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  100 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.541294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2624  hypothetical protein  50.29 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2318  hypothetical protein  43.46 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.889598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  40.82 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4774  hypothetical protein  41.24 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0322  hypothetical protein  37.63 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2307  hypothetical protein  32.43 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4169  hypothetical protein  33.5 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0623912  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4595  hypothetical protein  35.37 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0677  hypothetical protein  29.81 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0284  hypothetical protein  26.9 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0421  hypothetical protein  27.14 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0259078  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0257  hypothetical protein  28.71 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0329  hypothetical protein  29.44 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1485  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0313  hypothetical protein  25.91 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1596  hypothetical protein  25.25 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0241  hypothetical protein  27.09 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1769  hypothetical protein  23.96 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00740  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  27.32 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.603366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0336  hypothetical protein  25.93 
 
 		 216 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>