21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1485 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1485  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2318  hypothetical protein  31.47 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.889598 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0322  hypothetical protein  30.65 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4774  hypothetical protein  28.28 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0313  hypothetical protein  29.85 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  31 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2307  hypothetical protein  29.06 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1435  hypothetical protein  24.87 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185215  normal  0.679893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1596  hypothetical protein  30.77 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0284  hypothetical protein  23 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0677  hypothetical protein  26.15 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0421  hypothetical protein  24.88 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0259078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4169  hypothetical protein  24.61 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0623912  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0329  hypothetical protein  26.73 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2624  hypothetical protein  28.64 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23140  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  25 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.541294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4595  hypothetical protein  25.74 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0898  hypothetical protein  24.34 
 
 
199 aa  52  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2159  hypothetical protein  20.1 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3089  hypothetical protein  26.8 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0241  hypothetical protein  23.79 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>