21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3089 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3089  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0257  hypothetical protein  38.58 
 
 
200 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4169  hypothetical protein  32.03 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0623912  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0309  hypothetical protein  25.34 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0430221  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2307  hypothetical protein  29.11 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0336  hypothetical protein  24.43 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  27.55 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4595  hypothetical protein  36.6 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0421  hypothetical protein  25.91 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0259078  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0284  hypothetical protein  24.62 
 
 
200 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0329  hypothetical protein  29.08 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2159  hypothetical protein  28.93 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1485  hypothetical protein  26.8 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2318  hypothetical protein  24.23 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.889598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2657  hypothetical protein  30.5 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.020977  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0322  hypothetical protein  25.11 
 
 
212 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0907  hypothetical protein  24.48 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1769  hypothetical protein  24.23 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0241  hypothetical protein  23.56 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1596  hypothetical protein  32.93 
 
 
193 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4774  hypothetical protein  23.18 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>