18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1596 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1596  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1485  hypothetical protein  30.77 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4169  hypothetical protein  27.32 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0623912  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4595  hypothetical protein  29.74 
 
 
215 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0322  hypothetical protein  24.44 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0677  hypothetical protein  26.7 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2624  hypothetical protein  29.95 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  25.38 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2318  hypothetical protein  29.01 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.889598 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0257  hypothetical protein  23.76 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4774  hypothetical protein  27.27 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2307  hypothetical protein  22.39 
 
 
212 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2159  hypothetical protein  27.18 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23140  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  26.17 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.541294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0284  hypothetical protein  32.11 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3089  hypothetical protein  32.93 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0907  hypothetical protein  33.03 
 
 
198 aa  41.6  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0241  hypothetical protein  24.17 
 
 
200 aa  41.6  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>