21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00740  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.603366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0322  hypothetical protein  31.31 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4774  hypothetical protein  31.16 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0329  hypothetical protein  31.16 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0677  hypothetical protein  31.96 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0421  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0259078  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2624  hypothetical protein  31.44 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  28.5 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2318  hypothetical protein  25.5 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.889598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4169  hypothetical protein  26.07 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0623912  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0898  hypothetical protein  26.56 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0284  hypothetical protein  25.25 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2307  hypothetical protein  27.18 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2159  hypothetical protein  25.24 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23140  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02185  29.38 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.541294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0313  hypothetical protein  27.84 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0241  hypothetical protein  25.87 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0257  hypothetical protein  27.62 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4595  hypothetical protein  26.42 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1435  hypothetical protein  27.7 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185215  normal  0.679893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1769  hypothetical protein  24.51 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>