40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2808 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  344  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1718  hypothetical protein  73.29 
 
 		 154 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0029382  normal  0.239872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1844  hypothetical protein  73.1 
 
 		 163 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000465325  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1643  hypothetical protein  70.39 
 
 		 154 aa  227  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000122978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1939  hypothetical protein  72.6 
 
 		 149 aa  226  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1718  hypothetical protein  68.42 
 
 		 154 aa  221  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000386027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2507  hypothetical protein  70.55 
 
 		 149 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000287675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2620  hypothetical protein  69.86 
 
 		 149 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000901127  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2500  hypothetical protein  67.81 
 
 		 149 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000375646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1663  hypothetical protein  67.36 
 
 		 173 aa  207  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.039673  normal  0.0367113 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1844  hypothetical protein  66.44 
 
 		 149 aa  203  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000036265  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2336  hypothetical protein  58.82 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2261  hypothetical protein  63.01 
 
 		 149 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1595  hypothetical protein  59.06 
 
 		 164 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000010265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1798  hypothetical protein  53.52 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1436  hypothetical protein  62.62 
 
 		 128 aa  151  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00146467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  27.46 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3149  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00318163  normal  0.304263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2917  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0019531  normal  0.702822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3094  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.269583  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3168  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00128116  normal  0.40591 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4039  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102498  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3110  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3085  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000118024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0933  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829724  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02624  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000285005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3083  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2923  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182866  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000255384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  27.52 
 
 		 335 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0909  Phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0795  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 431 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.666938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3266  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  0.113056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1215  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3233  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 431 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0388546  normal  0.0683128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0852  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1771  hypothetical protein  23.23 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3386  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 431 aa  41.2  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0680089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3545  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 431 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0818  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 		 432 aa  41.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.799798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>