21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1844 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1844  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  315  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000036265  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2500  hypothetical protein  95.97 
 
 
149 aa  304  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000375646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2620  hypothetical protein  94.63 
 
 
149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000901127  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2507  hypothetical protein  93.96 
 
 
149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000287675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1643  hypothetical protein  74.5 
 
 
154 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000122978  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1718  hypothetical protein  73.15 
 
 
154 aa  237  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000386027  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1718  hypothetical protein  73.83 
 
 
154 aa  236  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0029382  normal  0.239872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2261  hypothetical protein  72.48 
 
 
149 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1939  hypothetical protein  71.14 
 
 
149 aa  229  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2336  hypothetical protein  62.84 
 
 
161 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2808  hypothetical protein  66.44 
 
 
163 aa  203  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1844  hypothetical protein  65.1 
 
 
163 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000465325  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1595  hypothetical protein  62.33 
 
 
164 aa  197  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000010265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1663  hypothetical protein  61.9 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.039673  normal  0.0367113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1798  hypothetical protein  54.93 
 
 
154 aa  157  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1436  hypothetical protein  56.45 
 
 
128 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00146467  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  28.86 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2708  hypothetical protein  32.19 
 
 
133 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003544  hypothetical protein  27.63 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1215  hypothetical protein  29.17 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0834  hypothetical protein  29.58 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000171191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>