20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1595 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1595  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  347  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000010265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1718  hypothetical protein  62.25 
 
 		 154 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0029382  normal  0.239872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2336  hypothetical protein  58.64 
 
 		 161 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2261  hypothetical protein  60.96 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2500  hypothetical protein  63.7 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000375646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1643  hypothetical protein  62.5 
 
 		 154 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000122978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1718  hypothetical protein  61.84 
 
 		 154 aa  204  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000386027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1939  hypothetical protein  63.7 
 
 		 149 aa  203  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2507  hypothetical protein  63.7 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000287675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2620  hypothetical protein  63.01 
 
 		 149 aa  201  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000901127  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1844  hypothetical protein  60.14 
 
 		 163 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000465325  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1844  hypothetical protein  62.33 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000036265  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1663  hypothetical protein  58.9 
 
 		 173 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.039673  normal  0.0367113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2808  hypothetical protein  59.06 
 
 		 163 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1436  hypothetical protein  60.38 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00146467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1798  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2708  hypothetical protein  31.33 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  30.22 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003544  hypothetical protein  31.21 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1215  hypothetical protein  29.93 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>