23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1215 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1215  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  315  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2708  hypothetical protein  63.93 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003544  hypothetical protein  59.68 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  58.87 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0834  hypothetical protein  54.62 
 
 		 125 aa  144  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000171191  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  25.2 
 
 		 520 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2336  hypothetical protein  28.47 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1663  hypothetical protein  28 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.039673  normal  0.0367113 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1844  hypothetical protein  29.17 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000036265  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2500  hypothetical protein  29.17 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000375646  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  29.01 
 
 		 523 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  28.66 
 
 		 532 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1595  hypothetical protein  29.93 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000010265  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  37.93 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  30.08 
 
 		 523 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  28.57 
 
 		 533 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2507  hypothetical protein  27.46 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000287675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  28.57 
 
 		 529 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2808  hypothetical protein  28.28 
 
 		 163 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  25.86 
 
 		 544 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2620  hypothetical protein  29.86 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000901127  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2611  hypothetical protein  26.95 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  27.34 
 
 		 508 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>