95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0681 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0681  phospholipase A(1)  100 
 
 		 297 aa  616  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00937714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0786  phospholipase A(2)  78.47 
 
 		 331 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000253748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0671  phospholipase A(1)  79.64 
 
 		 308 aa  461  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2893  phospholipase A(1)  75.43 
 
 		 294 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0661  phospholipase A(1)  74.55 
 
 		 321 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0955  phospholipase A1  70.33 
 
 		 305 aa  441  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000243291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0926  phospholipase A(1)  70.61 
 
 		 294 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3410  phospholipase A(1)  70.61 
 
 		 294 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0960  phospholipase A(1)  70.27 
 
 		 294 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0952  Phospholipase A(1)  70.61 
 
 		 294 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0861  phospholipase A1  69.02 
 
 		 294 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000319394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3189  phospholipase A(1)  74.64 
 
 		 302 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0898  phospholipase A(1)  69.02 
 
 		 294 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3074  phospholipase A(1)  69.02 
 
 		 294 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144403  normal  0.81386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3045  phospholipase A(1)  70.37 
 
 		 293 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3432  Phospholipase A(1)  46.93 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3291  phospholipase A(1)  44.88 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000246  outer membrane phospholipase A  46.55 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0489  phospholipase A1  45.49 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1446  phospholipase A1  40.88 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0096  phospholipase  43.42 
 
 		 352 aa  221  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0828092  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2081  phospholipase A1  45.3 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02967  Outer membrane phospholipase A  41.4 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0459  phospholipase A(1)  41.97 
 
 		 365 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0625  phospholipase A(1)  41.54 
 
 		 373 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1960  phospholipase A1  43.59 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0217  phospholipase A  37.5 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2651  Phospholipase A(1)  39.5 
 
 		 384 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3999  phospholipase A  37.5 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000768717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0554  phospholipase A  37.5 
 
 		 292 aa  202  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3493  phospholipase A(1)  38.81 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0192  phospholipase A  39.93 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0192  phospholipase A  37.38 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0241  phospholipase A  36.63 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4155  phospholipase A  38.13 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00523334  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1437  Phospholipase A(2)  39.48 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.373887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3965  phospholipase A  37.09 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03649  hypothetical protein  37.28 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03700  outer membrane phospholipase A  37.28 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4188  phospholipase A  37.28 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102786 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4158  Phospholipase A(1)  36.92 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4187  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315576  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4045  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4342  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5262  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4288  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4237  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4284  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.271808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4165  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4186  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4344  phospholipase A  36.92 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2175  Phospholipase A(2)  38.4 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0231  outer membrane phospholipase A  38.13 
 
 		 478 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3975  phospholipase A  35.45 
 
 		 289 aa  168  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00682989  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2263  Phospholipase A(2)  36.72 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000355963  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1540  phospholipase A  40 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2026  phospholipase A(1)  38.08 
 
 		 433 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1350  phospholipase A  40 
 
 		 329 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0260  phospholipase A1  35.38 
 
 		 472 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.576984 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0610  phospholipase A  37.55 
 
 		 337 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0197  phospholipase A  36.9 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2191  putative two-component sensor  41.82 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00189508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0598  phospholipase A1  36.43 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000777366  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1587  phospholipase A1  36.43 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.168451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0719  Phospholipase A(2)  39.34 
 
 		 392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0126  phospholipase A  39.35 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2090  phospholipase A1  32.31 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4284  phospholipase A1  33.33 
 
 		 415 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0602496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3505  putative phospholipase A1 precursor (PldA)  31.56 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0598  phospholipase A1  34.08 
 
 		 421 aa  138  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4476  phospholipase A1  34.12 
 
 		 410 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3140  phospholipase A1  36.21 
 
 		 393 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3867  phospholipase A1  36.21 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  0.459094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0350  phospholipase A1  34.45 
 
 		 401 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53179  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1995  phospholipase A1 precursor  32.33 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0552  phospholipase A1  33.73 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0016  phospholipase A1  32.81 
 
 		 359 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0525  phospholipase  30.98 
 
 		 400 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2290  phospholipase A1  29.45 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02036  Outer membrane phospholipase A  31.64 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02841  phospholipase A  30.43 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2897  outer membrane phospholipase A  32.24 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4607  Outer membrane phospholipase A-like protein  27.74 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0328942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1006  putative phospholipase  33.19 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.542974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1042  putative phospholipase  31.44 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2311  putative outer membrane phospholipase A  29.61 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1948  putative outer membrane phospholipase A  29.49 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0928  phospholipase A1  32.43 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1069  putative phospholipase  29.44 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2465  phospholipase A1  31.94 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2871  outer membrane phospholipase A  32.41 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1397  putative phospholipase  30.21 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.203463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1581  hypothetical protein  26.47 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0769  outer membrane phospholipase A  28.49 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3729  phospholipase A  54 
 
 		 49 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>