95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3189 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3189  phospholipase A(1)  100 
 
 
302 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2893  phospholipase A(1)  75.17 
 
 
294 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406864  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0671  phospholipase A(1)  70.78 
 
 
308 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0861  phospholipase A1  70.34 
 
 
294 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000319394  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3074  phospholipase A(1)  70.14 
 
 
294 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144403  normal  0.81386 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0898  phospholipase A(1)  68.97 
 
 
294 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110394  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0955  phospholipase A1  71.99 
 
 
305 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000243291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0786  phospholipase A(2)  73.53 
 
 
331 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000253748  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0681  phospholipase A(1)  72.07 
 
 
297 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00937714  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3045  phospholipase A(1)  71.74 
 
 
293 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0960  phospholipase A(1)  68.62 
 
 
294 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213217  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3410  phospholipase A(1)  68.62 
 
 
294 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0926  phospholipase A(1)  68.62 
 
 
294 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0952  Phospholipase A(1)  68.62 
 
 
294 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23865  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0661  phospholipase A(1)  70.33 
 
 
321 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000246  outer membrane phospholipase A  51.09 
 
 
342 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3291  phospholipase A(1)  46.93 
 
 
331 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20613  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3432  Phospholipase A(1)  46.18 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0096  phospholipase  46.69 
 
 
352 aa  242  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0828092  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0489  phospholipase A1  45.15 
 
 
335 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2081  phospholipase A1  45.67 
 
 
296 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1446  phospholipase A1  40.88 
 
 
335 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0217  phospholipase A  41.02 
 
 
292 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3999  phospholipase A  41.02 
 
 
292 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000768717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0554  phospholipase A  41.02 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02967  Outer membrane phospholipase A  43.87 
 
 
339 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0459  phospholipase A(1)  43.8 
 
 
365 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0625  phospholipase A(1)  43.01 
 
 
373 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1960  phospholipase A1  44.28 
 
 
345 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3493  phospholipase A(1)  40.21 
 
 
285 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1437  Phospholipase A(2)  40.86 
 
 
330 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.373887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2651  Phospholipase A(1)  42.25 
 
 
384 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0241  phospholipase A  41.51 
 
 
289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0192  phospholipase A  41.76 
 
 
289 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0192  phospholipase A  40.75 
 
 
292 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4155  phospholipase A  39.85 
 
 
288 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00523334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3965  phospholipase A  40.08 
 
 
290 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4158  Phospholipase A(1)  38.35 
 
 
289 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03700  outer membrane phospholipase A  38.72 
 
 
289 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4342  phospholipase A  38.35 
 
 
289 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4045  phospholipase A  38.35 
 
 
289 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4187  phospholipase A  38.35 
 
 
289 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315576  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03649  hypothetical protein  38.72 
 
 
289 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5262  phospholipase A  38.35 
 
 
289 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4188  phospholipase A  37.97 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0102786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4344  phospholipase A  38.72 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4288  phospholipase A  39.45 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4186  phospholipase A  38.72 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4237  phospholipase A  38.72 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4284  phospholipase A  38.72 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.271808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4165  phospholipase A  38.72 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3975  phospholipase A  35.76 
 
 
289 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00682989  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0231  outer membrane phospholipase A  40.31 
 
 
478 aa  176  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1587  phospholipase A1  35.84 
 
 
344 aa  171  9e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.168451  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0598  phospholipase A1  35.84 
 
 
344 aa  171  9e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000777366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2175  Phospholipase A(2)  37.86 
 
 
310 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2263  Phospholipase A(2)  37.11 
 
 
334 aa  169  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000355963  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0197  phospholipase A  39.37 
 
 
340 aa  169  5e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1350  phospholipase A  41.96 
 
 
329 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1540  phospholipase A  41.47 
 
 
329 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0260  phospholipase A1  36.54 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.576984 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2026  phospholipase A(1)  37.31 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314186  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3505  putative phospholipase A1 precursor (PldA)  36.19 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2191  putative two-component sensor  38.71 
 
 
320 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00189508  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0610  phospholipase A  37.8 
 
 
337 aa  159  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0719  Phospholipase A(2)  34.56 
 
 
392 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2090  phospholipase A1  34.81 
 
 
343 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152722  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0126  phospholipase A  40.38 
 
 
322 aa  151  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3140  phospholipase A1  34.98 
 
 
393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3867  phospholipase A1  34.98 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  0.459094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0598  phospholipase A1  35.09 
 
 
421 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4284  phospholipase A1  35.47 
 
 
415 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0602496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2290  phospholipase A1  31.83 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0350  phospholipase A1  35.34 
 
 
401 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53179  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4476  phospholipase A1  34.89 
 
 
410 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0016  phospholipase A1  32.94 
 
 
359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1995  phospholipase A1 precursor  35.45 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0525  phospholipase  36.14 
 
 
400 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02036  Outer membrane phospholipase A  33.07 
 
 
239 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0552  phospholipase A1  33.05 
 
 
406 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02841  phospholipase A  31.34 
 
 
282 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4607  Outer membrane phospholipase A-like protein  27.61 
 
 
273 aa  89.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0328942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2897  outer membrane phospholipase A  31.09 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0928  phospholipase A1  33.77 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1581  hypothetical protein  29.46 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0639269  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1069  putative phospholipase  31.98 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1948  putative outer membrane phospholipase A  30.74 
 
 
452 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267427  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2311  putative outer membrane phospholipase A  30.3 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2465  phospholipase A1  30.74 
 
 
431 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2871  outer membrane phospholipase A  31.28 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1042  putative phospholipase  32.88 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1006  putative phospholipase  31.78 
 
 
469 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.542974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1397  putative phospholipase  31.62 
 
 
392 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.203463  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0769  outer membrane phospholipase A  32.45 
 
 
215 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3729  phospholipase A  57.78 
 
 
49 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>