94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2465 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2465  phospholipase A1  100 
 
 		 431 aa  869    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2871  outer membrane phospholipase A  92.11 
 
 		 431 aa  790    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1042  putative phospholipase  54.29 
 
 		 417 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1006  putative phospholipase  53.16 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.542974 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1069  putative phospholipase  44.57 
 
 		 412 aa  346  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2311  putative outer membrane phospholipase A  44.96 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1948  putative outer membrane phospholipase A  45.5 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1397  putative phospholipase  37.25 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.203463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1581  hypothetical protein  40.16 
 
 		 407 aa  179  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0928  phospholipase A1  35.22 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2897  outer membrane phospholipase A  33.75 
 
 		 301 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0260  phospholipase A1  36.02 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.576984 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0231  outer membrane phospholipase A  34.6 
 
 		 478 aa  103  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2191  putative two-component sensor  34.58 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00189508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0197  phospholipase A  33.93 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0610  phospholipase A  31.53 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1437  Phospholipase A(2)  33.77 
 
 		 330 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.373887  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2263  Phospholipase A(2)  31.8 
 
 		 334 aa  97.1  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000355963  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0625  phospholipase A(1)  32.27 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0126  phospholipase A  33.15 
 
 		 322 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2651  Phospholipase A(1)  35.14 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000246  outer membrane phospholipase A  34.67 
 
 		 342 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3291  phospholipase A(1)  31.6 
 
 		 331 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2026  phospholipase A(1)  31.47 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1446  phospholipase A1  33.05 
 
 		 335 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3975  phospholipase A  33.18 
 
 		 289 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00682989  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02967  Outer membrane phospholipase A  33.93 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1540  phospholipase A  32.22 
 
 		 329 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4165  phospholipase A  32.57 
 
 		 289 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4237  phospholipase A  32.57 
 
 		 289 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4284  phospholipase A  32.57 
 
 		 289 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.271808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4186  phospholipase A  32.57 
 
 		 289 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4344  phospholipase A  32.57 
 
 		 289 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03649  hypothetical protein  32.11 
 
 		 289 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03700  outer membrane phospholipase A  32.11 
 
 		 289 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4288  phospholipase A  32.11 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4188  phospholipase A  32.11 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4187  phospholipase A  32.11 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315576  normal  0.684976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4158  Phospholipase A(1)  32.11 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4342  phospholipase A  32.11 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4045  phospholipase A  32.11 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5262  phospholipase A  32.11 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4284  phospholipase A1  31.19 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0602496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4607  Outer membrane phospholipase A-like protein  32.42 
 
 		 273 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0328942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1350  phospholipase A  32.22 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0898  phospholipase A(1)  34.21 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0459  phospholipase A(1)  30.74 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3505  putative phospholipase A1 precursor (PldA)  33.33 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0096  phospholipase  32.2 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0828092  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4155  phospholipase A  33.49 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00523334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3074  phospholipase A(1)  33.33 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144403  normal  0.81386 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0489  phospholipase A1  26.77 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0552  phospholipase A1  30.63 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0926  phospholipase A(1)  31.91 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0952  Phospholipase A(1)  31.91 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0719  Phospholipase A(2)  29.73 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0861  phospholipase A1  32.61 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000319394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0960  phospholipase A(1)  31.91 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3410  phospholipase A(1)  31.91 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3045  phospholipase A(1)  32.34 
 
 		 293 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0598  phospholipase A1  30.05 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000777366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0554  phospholipase A  31.8 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3999  phospholipase A  31.8 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000768717  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0217  phospholipase A  31.8 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3965  phospholipase A  32.56 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0192  phospholipase A  32.3 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1587  phospholipase A1  30.05 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.168451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0192  phospholipase A  32.26 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2175  Phospholipase A(2)  26.83 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2290  phospholipase A1  31.55 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2090  phospholipase A1  31.95 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3140  phospholipase A1  28.79 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0241  phospholipase A  31.6 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3867  phospholipase A1  29.32 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  0.459094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3432  Phospholipase A(1)  30.05 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2893  phospholipase A(1)  32.46 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0671  phospholipase A(1)  31.6 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3189  phospholipase A(1)  30.74 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1960  phospholipase A1  31.31 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0786  phospholipase A(2)  31.96 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000253748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0016  phospholipase A1  28.09 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0598  phospholipase A1  28.3 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0350  phospholipase A1  30.67 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53179  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0681  phospholipase A(1)  31.94 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00937714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0661  phospholipase A(1)  30.8 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0955  phospholipase A1  29.87 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000243291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4476  phospholipase A1  28.14 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3493  phospholipase A(1)  31.4 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0525  phospholipase  30.36 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1995  phospholipase A1 precursor  28.57 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02841  phospholipase A  26.44 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0769  outer membrane phospholipase A  25 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2081  phospholipase A1  27.85 
 
 		 296 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02036  Outer membrane phospholipase A  30.1 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>