94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0489 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0489  phospholipase A1  100 
 
 		 335 aa  702    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0955  phospholipase A1  44.86 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000243291  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0671  phospholipase A(1)  45 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387577 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0898  phospholipase A(1)  45.99 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0861  phospholipase A1  45.62 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000319394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0786  phospholipase A(2)  41.81 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000253748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0096  phospholipase  45.08 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0828092  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3074  phospholipase A(1)  45.62 
 
 		 294 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144403  normal  0.81386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0681  phospholipase A(1)  45.49 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00937714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0926  phospholipase A(1)  45.62 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3410  phospholipase A(1)  45.62 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0952  Phospholipase A(1)  45.62 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0960  phospholipase A(1)  45.62 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0661  phospholipase A(1)  43.48 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2893  phospholipase A(1)  45.05 
 
 		 294 aa  231  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3432  Phospholipase A(1)  42.32 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3189  phospholipase A(1)  44.32 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3045  phospholipase A(1)  45.45 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3291  phospholipase A(1)  40.41 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2651  Phospholipase A(1)  41.16 
 
 		 384 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3493  phospholipase A(1)  39.55 
 
 		 285 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1446  phospholipase A1  40.07 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000246  outer membrane phospholipase A  36.47 
 
 		 342 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1960  phospholipase A1  38.33 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2081  phospholipase A1  37.25 
 
 		 296 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0217  phospholipase A  36.21 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3999  phospholipase A  36.21 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000768717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0554  phospholipase A  36.21 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0192  phospholipase A  40.16 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4155  phospholipase A  41.3 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00523334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02967  Outer membrane phospholipase A  36.26 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1437  Phospholipase A(2)  36.77 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.373887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0625  phospholipase A(1)  35.28 
 
 		 373 aa  178  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3965  phospholipase A  41.3 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2175  Phospholipase A(2)  32.61 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0231  outer membrane phospholipase A  35.84 
 
 		 478 aa  172  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0459  phospholipase A(1)  34.77 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409013  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0260  phospholipase A1  33.55 
 
 		 472 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.576984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0192  phospholipase A  39.27 
 
 		 289 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0241  phospholipase A  35.36 
 
 		 289 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4165  phospholipase A  37.25 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4186  phospholipase A  37.25 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4344  phospholipase A  37.25 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4237  phospholipase A  37.25 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4284  phospholipase A  37.25 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.271808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4188  phospholipase A  37.2 
 
 		 289 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102786 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0598  phospholipase A1  33.56 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000777366  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1587  phospholipase A1  33.56 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.168451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4187  phospholipase A  37.2 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315576  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5262  phospholipase A  37.2 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.658855 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4158  Phospholipase A(1)  37.2 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4045  phospholipase A  37.2 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4342  phospholipase A  37.2 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4288  phospholipase A  37.5 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03700  outer membrane phospholipase A  37.2 
 
 		 289 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03649  hypothetical protein  37.2 
 
 		 289 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3975  phospholipase A  35.34 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00682989  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2026  phospholipase A(1)  33.58 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0126  phospholipase A  35.82 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0197  phospholipase A  32.82 
 
 		 340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2191  putative two-component sensor  39.34 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00189508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4284  phospholipase A1  35.13 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0602496 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2263  Phospholipase A(2)  34.26 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000355963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4476  phospholipase A1  33.55 
 
 		 410 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0350  phospholipase A1  34.29 
 
 		 401 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53179  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3505  putative phospholipase A1 precursor (PldA)  33.81 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0552  phospholipase A1  36.59 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1350  phospholipase A  32.64 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3140  phospholipase A1  35.43 
 
 		 393 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2090  phospholipase A1  31.25 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1540  phospholipase A  31.94 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3867  phospholipase A1  34 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  0.459094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0719  Phospholipase A(2)  34.55 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0610  phospholipase A  31.35 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0598  phospholipase A1  33.81 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0016  phospholipase A1  30.41 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2290  phospholipase A1  31.65 
 
 		 285 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02036  Outer membrane phospholipase A  34.41 
 
 		 239 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0525  phospholipase  36.16 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1995  phospholipase A1 precursor  32.92 
 
 		 257 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02841  phospholipase A  32.51 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2465  phospholipase A1  30.3 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2897  outer membrane phospholipase A  28.89 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2871  outer membrane phospholipase A  29.18 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1042  putative phospholipase  31.02 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4607  Outer membrane phospholipase A-like protein  27.03 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0328942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1581  hypothetical protein  28.76 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0928  phospholipase A1  30.61 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1397  putative phospholipase  29.6 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.203463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1006  putative phospholipase  28.97 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.542974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1948  putative outer membrane phospholipase A  25.96 
 
 		 452 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2311  putative outer membrane phospholipase A  23.98 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246188 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1069  putative phospholipase  21.76 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0769  outer membrane phospholipase A  32.14 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>