15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3729 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3729  phospholipase A  100 
 
 		 49 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0861  phospholipase A1  85.71 
 
 		 294 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000319394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0898  phospholipase A(1)  83.67 
 
 		 294 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3074  phospholipase A(1)  81.63 
 
 		 294 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144403  normal  0.81386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3410  phospholipase A(1)  67.35 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0926  phospholipase A(1)  67.35 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0960  phospholipase A(1)  67.35 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0952  Phospholipase A(1)  67.35 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3045  phospholipase A(1)  69.39 
 
 		 293 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2893  phospholipase A(1)  64.86 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0681  phospholipase A(1)  54 
 
 		 297 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00937714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0955  phospholipase A1  70 
 
 		 305 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000243291  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0671  phospholipase A(1)  75 
 
 		 308 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3189  phospholipase A(1)  72.41 
 
 		 302 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0786  phospholipase A(2)  73.08 
 
 		 331 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000253748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>