20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5495 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5495  membrane protein-like protein  100 
 
 		 481 aa  957    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671305  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4215  hypothetical protein  27.94 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2678  hypothetical protein  23.85 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397076  normal  0.0401101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1341  hypothetical protein  23.66 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3822  hypothetical protein  23.75 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0953  hypothetical protein  28.95 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.206093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0468  hypothetical protein  24.68 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45143  predicted protein  23.31 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537975  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1379  membrane protein-like protein  22.85 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0469638  normal  0.415968 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6041  hypothetical protein  25.98 
 
 		 430 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2342  hypothetical protein  25.57 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0185425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2732  hypothetical protein  24.63 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2028  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.56 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2389  hypothetical protein  24.57 
 
 		 444 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1904  N-6 Adenine-specific DNA methylase  25.87 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.919082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4135  hypothetical protein  23.72 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.938574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3329  hypothetical protein  22.18 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1264  hypothetical protein  23.64 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  0.593096 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3825  Protein of unknown function DUF2254, membrane  22.64 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5129  hypothetical protein  26.52 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>