20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3323 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3323  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0549  hypothetical protein  68.83 
 
 
154 aa  207  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.470916  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3759  hypothetical protein  78.57 
 
 
126 aa  203  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3941  hypothetical protein  78.57 
 
 
126 aa  203  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.380145  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0509  hypothetical protein  78.57 
 
 
126 aa  203  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000700122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3815  hypothetical protein  78.57 
 
 
126 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00633545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0550  hypothetical protein  75 
 
 
139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3480  hypothetical protein  71.43 
 
 
127 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0550  hypothetical protein  71.43 
 
 
127 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0431  hypothetical protein  56.41 
 
 
136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0602  hypothetical protein  48.7 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3729  hypothetical protein  49.28 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4351  hypothetical protein  50.43 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3530  hypothetical protein  43.51 
 
 
135 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0660  hypothetical protein  45.13 
 
 
140 aa  100  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3156  hypothetical protein  41.88 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1209  hypothetical protein  30.5 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.799807  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1242  hypothetical protein  30.5 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.45898  normal  0.329943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3148  hypothetical protein  30.5 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0171848  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1165  hypothetical protein  30.5 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.798493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>