16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0549 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0549  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  303  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.470916  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0550  hypothetical protein  88.81 
 
 
139 aa  238  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0550  hypothetical protein  93.7 
 
 
127 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3480  hypothetical protein  93.7 
 
 
127 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3323  hypothetical protein  68.83 
 
 
154 aa  207  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0509  hypothetical protein  73.02 
 
 
126 aa  190  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000700122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3941  hypothetical protein  73.02 
 
 
126 aa  190  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.380145  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3759  hypothetical protein  73.02 
 
 
126 aa  190  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3815  hypothetical protein  72.22 
 
 
126 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00633545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0431  hypothetical protein  53.17 
 
 
136 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0602  hypothetical protein  49.6 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3530  hypothetical protein  45.74 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3729  hypothetical protein  49.17 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4351  hypothetical protein  43.9 
 
 
133 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0660  hypothetical protein  49.12 
 
 
140 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3156  hypothetical protein  40.18 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>