16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3156 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3156  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  270  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0431  hypothetical protein  43.7 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4351  hypothetical protein  47.41 
 
 		 133 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0602  hypothetical protein  44.35 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0509  hypothetical protein  40.8 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000700122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3323  hypothetical protein  42.4 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3941  hypothetical protein  40.8 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.380145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3759  hypothetical protein  40.8 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3815  hypothetical protein  40.8 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00633545  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0549  hypothetical protein  40.83 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0550  hypothetical protein  41.67 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0550  hypothetical protein  40.83 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3480  hypothetical protein  40.83 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3530  hypothetical protein  39.02 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3729  hypothetical protein  39.06 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0660  hypothetical protein  40.87 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>