16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0550 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0550  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0549  hypothetical protein  88.81 
 
 		 154 aa  238  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0550  hypothetical protein  92.91 
 
 		 127 aa  234  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3480  hypothetical protein  92.91 
 
 		 127 aa  234  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0509  hypothetical protein  74.6 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000700122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3941  hypothetical protein  74.6 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.380145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3759  hypothetical protein  74.6 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3323  hypothetical protein  75 
 
 		 154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3815  hypothetical protein  73.81 
 
 		 126 aa  193  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00633545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0431  hypothetical protein  52.38 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3530  hypothetical protein  45.8 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0602  hypothetical protein  53.15 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4351  hypothetical protein  47.5 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3729  hypothetical protein  50.83 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0660  hypothetical protein  48.25 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3156  hypothetical protein  41.07 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>