66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0147 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  100 
 
 		 519 aa  1028    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  93.64 
 
 		 519 aa  969    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  93.44 
 
 		 519 aa  962    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  93.24 
 
 		 519 aa  959    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  93.44 
 
 		 519 aa  964    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  60.91 
 
 		 515 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  57.82 
 
 		 518 aa  585  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  57.45 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  55.83 
 
 		 520 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  56.3 
 
 		 519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  58.86 
 
 		 519 aa  569  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  56.1 
 
 		 519 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  55.51 
 
 		 519 aa  559  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  55.12 
 
 		 519 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  43.5 
 
 		 520 aa  451  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  43.5 
 
 		 518 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  43.31 
 
 		 518 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  45.44 
 
 		 518 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  45.13 
 
 		 519 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  39.57 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  44.47 
 
 		 529 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  42.86 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  43.44 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  38.54 
 
 		 511 aa  355  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  42.69 
 
 		 535 aa  352  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  41.31 
 
 		 537 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  41.84 
 
 		 540 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  41.84 
 
 		 540 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  41.84 
 
 		 540 aa  349  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  42.8 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  42.09 
 
 		 534 aa  348  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  41.86 
 
 		 535 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  41.25 
 
 		 535 aa  347  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  41.3 
 
 		 535 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  41.1 
 
 		 539 aa  347  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  41.25 
 
 		 530 aa  342  9e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  41.86 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  41.46 
 
 		 539 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  41.56 
 
 		 538 aa  339  9e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  41.25 
 
 		 528 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  41.65 
 
 		 538 aa  336  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  40.8 
 
 		 532 aa  332  9e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  41.6 
 
 		 522 aa  329  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  38.98 
 
 		 525 aa  316  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  35.35 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  35.35 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  36.06 
 
 		 506 aa  300  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  37.19 
 
 		 514 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  35.38 
 
 		 585 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.47 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  34.31 
 
 		 523 aa  255  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.67 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.67 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.67 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.6 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  33.73 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.73 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  33.73 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.67 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  33.67 
 
 		 508 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  31 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  33.64 
 
 		 552 aa  226  9e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  35.34 
 
 		 305 aa  140  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  32.41 
 
 		 263 aa  123  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  45.61 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  32.76 
 
 		 455 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>