67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0160 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  93.64 
 
 		 519 aa  969    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  100 
 
 		 519 aa  1023    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  92.86 
 
 		 519 aa  958    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  93.05 
 
 		 519 aa  959    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  92.86 
 
 		 519 aa  956    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  61.71 
 
 		 515 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  59.41 
 
 		 518 aa  598  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  58.61 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  56.98 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  57.28 
 
 		 519 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  59.25 
 
 		 519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  55.51 
 
 		 519 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  55.91 
 
 		 519 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  54.28 
 
 		 519 aa  555  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  43.33 
 
 		 520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  44.49 
 
 		 518 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  44.29 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  45.44 
 
 		 518 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  45.33 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  39.17 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  43.18 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  43.99 
 
 		 512 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  43.62 
 
 		 516 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  39.13 
 
 		 511 aa  363  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  43.25 
 
 		 534 aa  362  6e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  42.75 
 
 		 537 aa  360  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  43.46 
 
 		 535 aa  359  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  43.36 
 
 		 540 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  43.16 
 
 		 540 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  43.16 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  44.31 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  42.5 
 
 		 539 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  42.69 
 
 		 535 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  42.69 
 
 		 535 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  44.14 
 
 		 534 aa  353  5e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  42.11 
 
 		 535 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  42.72 
 
 		 530 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  42.61 
 
 		 528 aa  348  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  43.13 
 
 		 538 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  42.5 
 
 		 539 aa  343  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  42.88 
 
 		 538 aa  343  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  41.33 
 
 		 532 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  43.4 
 
 		 522 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  40.87 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  35.55 
 
 		 512 aa  312  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  35.55 
 
 		 512 aa  312  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  36.85 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  36.65 
 
 		 514 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  34.85 
 
 		 585 aa  273  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.67 
 
 		 507 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  31.66 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  34.69 
 
 		 523 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.13 
 
 		 510 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.13 
 
 		 510 aa  256  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.13 
 
 		 508 aa  256  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.13 
 
 		 508 aa  256  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  33.13 
 
 		 508 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  33.13 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  33.13 
 
 		 508 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.13 
 
 		 508 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.81 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  34.98 
 
 		 552 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  32.55 
 
 		 305 aa  143  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  30.58 
 
 		 263 aa  118  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  25.83 
 
 		 462 aa  47  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  23.1 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  32.76 
 
 		 455 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>