28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4434 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4434  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702856  normal  0.182429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1916  hypothetical protein  52.83 
 
 
288 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329746  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3005  hypothetical protein  48.06 
 
 
308 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196318  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1662  hypothetical protein  50 
 
 
290 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.579464  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2028  hypothetical protein  50.4 
 
 
307 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.653439  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1345  hypothetical protein  43.75 
 
 
276 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2174  hypothetical protein  48.57 
 
 
304 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000774665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2352  hypothetical protein  48.98 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.267744  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1907  hypothetical protein  52.08 
 
 
288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386979  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3144  hypothetical protein  45.17 
 
 
286 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0152673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6053  hypothetical protein  46.9 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5414  hypothetical protein  47.92 
 
 
469 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13700  hypothetical protein  42.69 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2008  hypothetical protein  49.62 
 
 
317 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0992003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1129  hypothetical protein  43.14 
 
 
300 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3022  hypothetical protein  46.96 
 
 
236 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.338405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22100  hypothetical protein  43.53 
 
 
306 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00612076  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1091  hypothetical protein  29.12 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000523541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2045  hypothetical protein  29.73 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.425713  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1388  hypothetical protein  37.62 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0594  hypothetical protein  29.3 
 
 
265 aa  79  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1550  hypothetical protein  27.96 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1313  hypothetical protein  29.19 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1684  putative glycosyltransferase  29.02 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416881  hitchhiker  0.0067809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3085  hypothetical protein  41.46 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06630  hypothetical protein  29.7 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80482e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1611  hypothetical protein  36.07 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1449  hypothetical protein  28.52 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>