28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22100  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1662  hypothetical protein  60.78 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.579464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1345  hypothetical protein  61.01 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1129  hypothetical protein  53 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3144  hypothetical protein  50.57 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0152673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2028  hypothetical protein  50.74 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.653439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5414  hypothetical protein  49.43 
 
 		 469 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2352  hypothetical protein  49.43 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.267744  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3022  hypothetical protein  50.62 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.338405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6053  hypothetical protein  47.37 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13700  hypothetical protein  44.93 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2008  hypothetical protein  48.84 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0992003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2174  hypothetical protein  49.02 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000774665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1916  hypothetical protein  42.81 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329746  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4434  hypothetical protein  43.06 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702856  normal  0.182429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3005  hypothetical protein  43.88 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196318  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1907  hypothetical protein  45.96 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386979  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0594  hypothetical protein  38.58 
 
 		 265 aa  99  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1313  hypothetical protein  30.15 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2045  hypothetical protein  35.32 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.425713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1091  hypothetical protein  32.5 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000523541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06630  hypothetical protein  30.89 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80482e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1388  hypothetical protein  37.24 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1550  hypothetical protein  29.74 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1684  putative glycosyltransferase  29.38 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416881  hitchhiker  0.0067809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3085  hypothetical protein  35.1 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1611  hypothetical protein  42.31 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1449  hypothetical protein  35.53 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>